A veces, una copia de seguridad a nivel de hipervisor no es posible debido a limitaciones del producto de virtualización.
VMware vSphere no es compatible con las instantáneas de los equipos virtuales tolerantes a fallos, discos independientes y de discos Raw Device Mapping (RDM) en modo de compatibilidad física.
Microsoft Hyper-V no proporciona control para los discos de paso en un sistema anfitrión. Como resultado, el proveedor de instantáneas de software de Microsoft no puede proporcionar a Agent for Hyper-V las instantáneas de los discos de paso.